Akupunktiolla voidaan hoitaa lemmikin akuuttia tai kroonista kipua ja edesauttaa toipumista esimerkiksi leikkauksen jälkeen. Akupunktion vaikutus perustuu kipuimpulssien kulun muokkaamiseen hermostossa. Lisäksi akupunktio stimuloi elimistön omien tulehdusta ja kipua lievittävien välittäjäaineiden vapautumista. Akupunktio voidaan sisällyttää laajempaan hoito-/kuntoutussuunnitelmaan, tai sen avulla voidaan esimerkiksi vähentää annettavien kipulääkkeiden määrää. Tavallisesti akupunktiohoito aloitetaan 3-4 hoitokerralla noin viikon välein. Tämän jälkeen arvioidaan hoitovaste ja tehdään jatkosuunnitelma. Aloituksen jälkeen kroonisen kivun hoitoon riittää usein ylläpitokäynti kerran kuussa, joskus harvemminkin.